Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms