Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms