Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms