Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNS3Q9BQ31 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms