Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms