Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms