Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRF1Q92994 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRF1Q92994 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BRF1Q92994 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRF1Q92994 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRF1Q92994 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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BRF1Q92994 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRF1Q92994 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRF1Q92994 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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