Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms