Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CSNK2A3Q8NEV1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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