Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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ZNF548Q8NEK5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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