Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms