Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms