Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC191Q8NCU4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC191Q8NCU4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms