Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNLDC1Q8NA58 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms