Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF550Q7Z398 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF550Q7Z398 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms