Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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