Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENND5BQ6ZUT9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENND5BQ6ZUT9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms