Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX4L9Q6RFH8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms