Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZBED5Q49AG3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZBED5Q49AG3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms