Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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