Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRRQ15256 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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