Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms