Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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