Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCOA4Q13772 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms