Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TRAF3Q13114 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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