Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHAF1AQ13111 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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