Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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