Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POU3F1Q03052 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POU3F1Q03052 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms