Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms