Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD1P98174 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD1P98174 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms