Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RAB1AP62820 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1AP62820 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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