Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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