Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3S2P59780 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3S2P59780 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms