Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP9P55211 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP9P55211 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms