Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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