Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AFMP43652 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AFMP43652 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AFMP43652 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AFMP43652 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AFMP43652 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AFMP43652 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AFMP43652 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms