Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPC1P35052 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms