Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX2P28328 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms