Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL1P22362 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL1P22362 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL1P22362 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL1P22362 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL1P22362 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL1P22362 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL1P22362 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL1P22362 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL1P22362 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL1P22362 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL1P22362 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL1P22362 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms