Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms