Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
XBP1P17861 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XBP1P17861 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XBP1P17861 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XBP1P17861 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XBP1P17861 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms