Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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