Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA6P05013 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms