Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SURF6O75683 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SURF6O75683 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SURF6O75683 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SURF6O75683 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SURF6O75683 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SURF6O75683 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SURF6O75683 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SURF6O75683 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SURF6O75683 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SURF6O75683 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SURF6O75683 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SURF6O75683 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms