Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DENRO43583 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DENRO43583 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DENRO43583 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms