Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LINC00587B1AMM8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LINC00587B1AMM8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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LINC00587B1AMM8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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LINC00587B1AMM8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00587B1AMM8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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