Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KNCNA6PVL3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms