Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms