Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL42Q9P2K6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms