Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHDC1Q9NTX5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms